AXIMA SARAMIS. Система идентификации микроорганизмов

AXIMA SARAMIS - система идентификации микроорганизмов
Производитель: 
Shimadzu
Страна: 
Япония
Узнать цену Задать вопрос по данному товару

Области применения:

Помимо диагностики инфекционных заболеваний человека и животных систему масс-спектрометрической идентификации микроорганизмов можно применять в следующих областях:

  • Фундаментальные научные исследования
  • Разработка новых лекарств: анализ и сравнение белковых профилей бактериальных штаммов, устойчивых к лекарствам, для поиска новых мишеней фармакологического воздействия
  • Стандартизация микробиологических коллекций: быстрое сравнение и классификация штаммов из различных изолятов
  • Пищевая промышленность: анализ присутствия нежелательных микроорганизмов на ранних стадиях производства

SARAMIS™ – (Spectral ARchive And Microbial Identification System) - экспертная система на основе базы масспектрограмм интактных микроорганизмов производства SHIMADZU GROUP. Предназначена для типирования микроорганизмов на основании их масс-спектров.

  • Заменяет стандартные биохимические методы
  • Достоверный результат за две минуты
  • Высокая воспроизводимость анализа
  • Значительная экономия средств

Информация в базе данных (БД) SARAMIS организована в виде так называемых СуперСпектров (Superspectra™). Под этим термином подразумевается, что для каждого вида микроорганизмов сформирован характерный набор белков (биомаркеров), полученный на основе анализа не менее 20 масс-спектров этого вида. При этом образцы получены из различных источников (больниц, лабораторий, микробиологических коллекций). Каждый образец тщательно идентифицирован с помощью сиквенса 16s РНК или других сертифицированных методов анализа. Для родов и семейств охарактеризованных микроорганизмов сформированы наборы присущих только им биомаркеров. Структурированная таким образом база данных позволяет быстро и точно идентифицировать микробиологические штаммы, а при невозможности – примерно определять место микроорганизма в таксономической иерархии. По состоянию на начало 2009 года накоплены суперспектры более чем для 1600 видов и 230 родов. В БД SARAMIS™ входит также коллекция первичных масс-спектров микроорганизмов (FingerprintSpectra), состоящая из более чем 50.000 образцов.

Всего два шага до результата:

Шаг 1: Подготовка образца
Анализ начинается с того, что на подложке масс-спектрометра смешивают биоматериал из колонии бактерий и специальную матрицу (2',5' дигидроксибензойная кислота).

Шаг 2: Идентификация
После этого образец помещают в прибор и подвергают воздействию наносекундных лазерных импульсов. При этом молекулы матрицы и аналита (в частности, белки) переходят в газовую фазу, а протонированные молекулы матрицы взаимодействуют с белками, перенося на них положительный заряд. Под действием электрического поля ионизированные белки движутся от источника ионизации к детектору с ускорениями, обратно пропорциональными их атомным массам. Программное обеспечение прибора оценивает время пролета частиц и преобразует эту информацию в спектр молекулярных масс (масс-спектр).
Масс-спектр сравнивается со спектрами из базы данных AXIMA@SARAMIS, и на основании сведений о массах характеристических белков происходит идентификация микроорганизмов.

Результаты:
Экспертная система AXIMA@SARAMIS позволяет идентифицировать до 380 образцов в течение 5 часов работы.
Результаты появляются в виде удобной таблицы, которую можно экспортировать в любую программу обработки данных. Все результаты могут быть доступны любому компьютеру в лаборатории и могут быть переданы интерфейсу LIMS (Лабораторной Информационной Системе). Результаты сохраняются в сжатом формате или легко могут быть удалены уполномоченным персоналом. Результаты анализа выборочных образцов можно немедленно передать на карманный PC через W-ЛВС.

Пример кластеризации клинических образцов Streptococcus на основе MALDI-TOF масс-спектров см. фото. С помощью анализа и обработки всех спектров одного вида можно сгенерировать СуперСпектр, который будет являться эталоном для клинических изолятов.

Parle Parle
Electrolab Electrolab
NEWTRONIC NEWTRONIC
XPZ XPZ
SOLAR SOLAR
BEING BEING
Memmert Memmert
Wonsen Wonsen
BioTool BioTool
HUANYU HUANYU
Farmalabor Farmalabor
GVS GVS
AnD AnD
IKA IKA
Riva Riva
Iskra Pio Iskra Pio